.cram Fájlkiterjesztés
FájltípusCompressed Alignment File
| Fejlesztő | EBI |
| Kategória | Data Files |
| Formátum | Binary |
.CRAM opció száma
Az EBI által kifejlesztett tömörített igazítási fájlformátum, amely az Európai Molekuláris Biológiai Laboratórium egyik állomása; Rövid olvasási alignerekből, például a BWA-ból, a BBMap-ból és a BLAT-ból keletkező rövid DNS-szekvenciaolvasási sorrendeket tárol.
A CRAM fájlformátum hasonló a Binary Alignment / Map (BAM) fájlformátumhoz, de jobb fájltömörítést és egy átstrukturált oszlop orientált bináris konténerformátumot tartalmaz. Ahogy az adatmennyiségek növekednek a genetikai szoftver mezőben, a CRAM formátumot úgy tervezték, hogy csökkentsék az igazítási adatok lemezfejnyomását.
A rövid olvasási igazítás az a folyamat, amikor a szekvencia a genomból származik. Ez nehéz lehet, mivel a referencia genom meglehetősen nagy, és nem mindig keres pontos találatokat a referencia genomban. Rövid leolvasási alignereket használnak a találatok és a közeli egyezmények hatalmas szekvenciáinak keresésére. Mivel a szekvenciák olyan nagyok, a CRAM formátumok által biztosított tömörítés szükséges a fájlméretek kezelhetőségéhez.
| Windows |
|