Integrated Genome Browser
| Változat |
9 |
| Emelvénys | |
| Engedély | Open Source |
| Kategória | Scientific |
| Több információ
(látogasson el a kiadó honlapjára)
|
Szoftver felülvizsgálat
Főbb funkciók
- Támogatja a különböző genomformátumokat, mint például a GenBank és a FASTA
- Interaktív adatok nagyítással és panorámaképezéssel
- A genomok elérése és betöltése a QuickLoad webhelyekről
- Adatok átalakítása különböző gráf formákban
- Adatok megosztása a munkatársakkal a Dropbox segítségével
- Telepítse a bővítményeket további funkciókhoz
Az integrált genom-böngésző (IGB) egy nyílt forráskódú program, amelyet nagy genomikus adatkészletek megtekintésére és felfedezésére használnak. Megtekintheti a különböző adatformátumokat, kölcsönhatásba léphet az adatokkal, létrehozhat grafikonokat, mentheti az adatokat képként, és megoszthatja az adatokat a munkatársakkal. A program számos olyan formátumot támogat, mint a FASTA, BAM, BEDGRAPH, BigWIG, Cytoband és GenBank. Adatokat készíthet, és különböző grafikonformákká alakíthatja át, beleértve a nem megfelelő grafikonokat az adatkülönbségek és a mélységgörbék kiemeléséhez a lefedettség megjelenítéséhez. Az adatok segítségével az IGB nagyítási és panorámaképezési animációival is kölcsönhatásba léphet. Az IGB fejlett funkcionalitást biztosít a plugin támogatással a funkcionalitás és a munkafolyamat-automatizálás szkriptek használatával történő hozzáadásához. Az IGB továbbfejlesztett funkciókat biztosít az adatok megosztásához, függetlenül attól, hogy közzéteszi-e azt kiváló minőségű JPEG, PNG vagy SVG formátumú képként, vagy tárolja az adatokat a Dropboxban, hogy együttműködő partnerei hozzáférhessenek a projekthez.
Az IGB elsősorban egyetemi kutatók, biológusok és bioinformatikusok használják. Speciális eszközöket biztosít a különböző genomadat-formátumok megnyitásához, az adatok különböző gráfokként történő megjelenítéséhez, valamint az adatok megosztásához a munkatársakkal. Sajnos a program a folyamatos fejlesztés támogatására támaszkodik, ami azt jelenti, hogy a kérelem támogatása bármikor megszűnik. Az integrált genom-böngésző azonban még mindig alkalmas, testreszabható program azoknak a felhasználóknak, akik szeretnék feltárni és elemezni a genomadatokat.
Frissítve: 2016. június 29.
▶ Egyéb használt fájlkiterjesztések Integrated Genome Browser 9
| Támogatott fájltípusok | |
|---|---|
| .BED | UCSC BED Annotation Track File |
| .GB | GenBank Data File |
| .FASTA | FASTA Sequence File |
| .DAS | DeltaMaster Analysis Session |
| .SGR | SGR Genome Data File |
| .FA | FASTA Formatted Sequence File |
| .USEQ | USeq Genome Data File |
| További kapcsolódó fájlformátumok |
|---|